Details of Virus RNA

  Strain Information Strain Name
Rhinovirus
Strain Family
Picornaviridae
RNA Binding Site
5'UTR - IRES
  Virus Information Virus Name
Rhinovirus (RV)
Taxonomy ID 12059

Full list of proteins interacting with the 5'UTR - IRES of this Strain

Protein Name Uniprot ID Host Species Pro Info Detection Method Infection Cell Cell ID Cell Originated Tissue Infection Time Interaction Score Fold Change
Cold shock domain-containing protein E1 O75534 Homo sapiens Pro Info UV cross-linking (UVX) HeLa Cells (Human cervical carcinoma cell) . Cervix . . .

Virus RNA Sequence Information

>NC_038311.1 Human rhinovirus 1 strain ATCC VR-1559, complete genome TTAAAACTGGGTGTGGGTTGTTCCCACCCACACCACCCAATGGGTGTTGTACTCTGTTATTCCGGTAACT TTGTACGCCAGTTTTTCCCTCCCCTCCCCATCCTTTTACGTAACTTAGAAGTTTTAAATACAAGACCAAT AGTAGGCAACTCTCCAGGTTGTCTAAGGTCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTTGATGTTGATATGCTCCAA CAGGGCAAAAACAACAGATACCGTTATCCGCAAAGTGCCTACACAGAGCTTAGTAGGATTCTGAAAGATC TTTGGTTGGTCGTTCAGCTGCATACCCAGCAGTAGACCTTGCAGATGAGGCTGGACATTCCCCACTGGTA ACAGTGGTCCAGCCTGCGTGGCTGCCTGCGCACCTCTCATGAGGTGTGAAGCCAAAGATCGGACAGGGTG TGAAGAGCCGCGTGTGCTCACTTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGCGGCTAACCTTAAACCTGCAGCCAT GGCTCATAAGCCAATGAGTTTATGGTCGTAACGAGTAATTGCGGGATGGGACCGACTACTTTGGGTGTCC GTGTTTCACTTTTTCCTTTATTAATTGCTTATGGTGACAATATATATATTGATATATATTGGCATCATGG GCGCCCAGGTATCTAGACAAAATGTTGGTACACACTCAACCCAAAATTCAGTGTCAAATGGATCAAGTTT AAATTACTTTAATATAAATTACTTCAAGGATGCTGCCTCAAGTGGTGCATCTAGATTAGATTTCTCTCAA GATCCAAGCAAATTCACTGACCCAGTTAAAGATGTCTTAGAAAAGGGGATCCCAACACTACAATCACCAT CTGTTGAGGCTTGTGGCTATTCAGACAGGATTATGCAAATAACCAGAGGAGATTCAACAATCACATCTCA 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