Details of Virus RNA

  Strain Information Strain Name
Human foamy virus
Strain Family
Retroviridae
RNA Binding Site
5'UTR - stem lops
  Virus Information Virus Name
Human foamy virus (SFV-11)
Taxonomy ID 11641
GeneBank ID Y07725

Full list of proteins interacting with the 5'UTR - stem lops of this Strain

Protein Name Uniprot ID Host Species Pro Info Detection Method Infection Cell Cell ID Cell Originated Tissue Infection Time Interaction Score Fold Change
ELAV-like protein 1 Q15717 Homo sapiens Pro Info UV cross-linking (UVX) HEK293 Cells (Human embryonic kidney cell); Mesc cells (Embryonic stem cell) . Kidney . . .

Virus RNA Sequence Information

>Y07725.1 Human foamy virus proviral DNA, complete genome HFV TGTGGTGGAATGCCACTAGAAACTAGGGAAAACTAGGAGGAGAGTATTACAGGGAAGGAAGTGAAGAACC TCGTGACCCAAATACTCCTGCTCCTCATAGACGTACCTGGGATGAGAGACACAAGGTTCTTAAATTGTCC TCATTCGCTACTCCCTCTGACATCCAACGCTGGGCTACTAAAGCATTGCCTTATGGCTGGAAAGTGGTCA CCGAAAGCGGAAATGATTATACTAGCCGCAGAAAGATCAGAACATTGACAGAGATGACTCAGGATGAAAT TAGAAAAAGGTGGGAAAGTGGATATTGTGACCCCTTCATTGACTCAGGAAGTGACTCAGATGGACCCTTC TAAAAGCCACAGACAGTAAAAATGTGTTAGCACTTTATACAATATTATATCTGCTTAAGCTATAGAAGCT TTCACATACTCAGTAGCTGTTTCACAATCAACAAAACAATGATGATGTAATCATAAGGAAGTAGTTTAAA ATAGGTTAAGTAAGTTTACTGCAGTAGATAATCCCTGGGGAGGATCTGGCTCTGTAAGCTGGAACAGCAA TGTTTTCAGTTCCAATCCTCTCAAAGGAGAACCAGAGGGATGATGTGTTAGTTCAAATCCCATTATCCTC ATGGTTCCCTTTTCCATAGTTTACTATATTAATTTAAGGATAAGGTTATATATGCTTTGCTATCCCTGAA GGAAGCATAGCTCTTCAGGTAAAGAGGCCAGTATTAAAAGAGCTACCCTTCCTTTTCATATAAGGATCGA AACCTGCTTACGTTTTACTTTAATAAAGTTAAGTTTTAAGTTTTAACAGGAAATGCTCTTAGGCAGAAGG TAGCTCCCTCGACTGGGTGACAAGGAAGAAACCATTCAGGAAGTGCTTCCTTCTGCTCGGGGAGATACAT 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