Details of Virus RNA
Strain Information | Strain Name |
Zaire ebolavirus
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---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Strain Family |
Filoviridae
|
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RNA Binding Site |
GP
|
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Virus Information | Virus Name |
Zaire ebolavirus (ZEBOV)
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Taxonomy ID | 186538 |
Full list of Host ncRNAs interacting with the Virus RNA
HncRNA | Host Species | HncRNA Detail | PMID | Source | Target Gene | Target Gene ID | Target Gene Source | PMID | Source |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
hsa-miR-150-3p | Homo sapiens | HncRNA Info | 29772717 | ViRBase | TP53 | . | miRTarBase | 27081855 | miRTarBase |
Virus RNA Sequence Information
>NC_002549.1 Zaire ebolavirus isolate Ebola virus/H.sapiens-tc/COD/1976/Yambuku-Mayinga, complete genome
CGGACACACAAAAAGAAAGAAGAATTTTTAGGATCTTTTGTGTGCGAATAACTATGAGGAAGATTAATAA
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TTAAACGACCAAGATAAAATTGTTCATATCTCGCTAGCAGCTTAAAATATAAATGTAATAGGAGCTATAT
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ACCTCGGCTGAGAGAGTGTTTTTTCATTAACCTTCATCTTGTAAACGTTGAGCAAAATTGTTAAAAATAT
GAGGCGGGTTATATTGCCTACTGCTCCTCCTGAATATATGGAGGCCATATACCCTGTCAGGTCAAATTCA
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AGCATTCATCCTTGAAGCTATGGTGAATGTCATATCGGGCCCCAAAGTGCTAATGAAGCAAATTCCAATT
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CTTCATACACTATCACCCATTTCGGCAAGGCAACCAATCCACTTGTCAGAGTCAATCGGCTGGGTCCTGG
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CCAGTCCAACTACCCCAGTATTTCACCTTTGATTTGACAGCACTCAAACTGATCACCCAACCACTGCCTG
CTGCAACATGGACCGATGACACTCCAACAGGATCAAATGGAGCGTTGCGTCCAGGAATTTCATTTCATCC
AAAACTTCGCCCCATTCTTTTACCCAACAAAAGTGGGAAGAAGGGGAACAGTGCCGATCTAACATCTCCG
GAGAAAATCCAAGCAATAATGACTTCACTCCAGGACTTTAAGATCGTTCCAATTGATCCAACCAAAAATA
TCATGGGAATCGAAGTGCCAGAAACTCTGGTCCACAAGCTGACCGGTAAGAAGGTGACTTCTAAAAATGG
ACAACCAATCATCCCTGTTCTTTTGCCAAAGTACATTGGGTTGGACCCGGTGGCTCCAGGAGACCTCACC
ATGGTAATCACACAGGATTGTGACACGTGTCATTCTCCTGCAAGTCTTCCAGCTGTGATTGAGAAGTAAT
TGCAATAATTGACTCAGATCCAGTTTTATAGAATCTTCTCAGGGATAGTGATAACATCTATTTAGTAATC
CGTCCATTAGAGGAGACACTTTTAATTGATCAATATACTAAAGGTGCTTTACACCATTGTCTTTTTTCTC
TCCTAAATGTAGAACTTAACAAAAGACTCATAATATACTTGTTTTTAAAGGATTGATTGATGAAAGATCA
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TGTTTTCCAGAGTAGGGGTCGTCAGGTCCTTTTCAATCGTGTAACCAAAATAAACTCCACTAGAAGGATA
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TCAGTTGGACTGAATCTCGAAGGGAATGGAGTGGCAACTGACGTGCCATCTGCAACTAAAAGATGGGGCT
TCAGGTCCGGTGTCCCACCAAAGGTGGTCAATTATGAAGCTGGTGAATGGGCTGAAAACTGCTACAATCT
TGAAATCAAAAAACCTGACGGGAGTGAGTGTCTACCAGCAGCGCCAGACGGGATTCGGGGCTTCCCCCGG
TGCCGGTATGTGCACAAAGTATCAGGAACGGGACCGTGTGCCGGAGACTTTGCCTTCCATAAAGAGGGTG
CTTTCTTCCTGTATGATCGACTTGCTTCCACAGTTATCTACCGAGGAACGACTTTCGCTGAAGGTGTCGT
TGCATTTCTGATACTGCCCCAAGCTAAGAAGGACTTCTTCAGCTCACACCCCTTGAGAGAGCCGGTCAAT
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ATGAGACAGAGTACTTGTTCGAGGTTGACAATTTGACCTACGTCCAACTTGAATCAAGATTCACACCACA
GTTTCTGCTCCAGCTGAATGAGACAATATATACAAGTGGGAAAAGGAGCAATACCACGGGAAAACTAATT
TGGAAGGTCAACCCCGAAATTGATACAACAATCGGGGAGTGGGCCTTCTGGGAAACTAAAAAAACCTCAC
TAGAAAAATTCGCAGTGAAGAGTTGTCTTTCACAGTTGTATCAAACGGAGCCAAAAACATCAGTGGTCAG
AGTCCGGCGCGAACTTCTTCCGACCCAGGGACCAACACAACAACTGAAGACCACAAAATCATGGCTTCAG
AAAATTCCTCTGCAATGGTTCAAGTGCACAGTCAAGGAAGGGAAGCTGCAGTGTCGCATCTAACAACCCT
TGCCACAATCTCCACGAGTCCCCAATCCCTCACAACCAAACCAGGTCCGGACAACAGCACCCATAATACA
CCCGTGTATAAACTTGACATCTCTGAGGCAACTCAAGTTGAACAACATCACCGCAGAACAGACAACGACA
GCACAGCCTCCGACACTCCCTCTGCCACGACCGCAGCCGGACCCCCAAAAGCAGAGAACACCAACACGAG
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CTATTGCTGGAGTCGCAGGACTGATCACAGGCGGGAGAAGAACTCGAAGAGAAGCAATTGTCAATGCTCA
ACCCAAATGCAACCCTAATTTACATTACTGGACTACTCAGGATGAAGGTGCTGCAATCGGACTGGCCTGG
ATACCATATTTCGGGCCAGCAGCCGAGGGAATTTACATAGAGGGGCTAATGCACAATCAAGATGGTTTAA
TCTGTGGGTTGAGACAGCTGGCCAACGAGACGACTCAAGCTCTTCAACTGTTCCTGAGAGCCACAACTGA
GCTACGCACCTTTTCAATCCTCAACCGTAAGGCAATTGATTTCTTGCTGCAGCGATGGGGCGGCACATGC
CACATTCTGGGACCGGACTGCTGTATCGAACCACATGATTGGACCAAGAACATAACAGACAAAATTGATC
AGATTATTCATGATTTTGTTGATAAAACCCTTCCGGACCAGGGGGACAATGACAATTGGTGGACAGGATG
GAGACAATGGATACCGGCAGGTATTGGAGTTACAGGCGTTATAATTGCAGTTATCGCTTTATTCTGTATA
TGCAAATTTGTCTTTTAGTTTTTCTTCAGATTGCTTCATGGAAAAGCTCAGCCTCAAATCAATGAAACCA
GGATTTAATTATATGGATTACTTGAATCTAAGATTACTTGACAAATGATAATATAATACACTGGAGCTTT
AAACATAGCCAATGTGATTCTAACTCCTTTAAACTCACAGTTAATCATAAACAAGGTTTGACATCAATCT
AGTTATCTCTTTGAGAATGATAAACTTGATGAAGATTAAGAAAAAGGTAATCTTTCGATTATCTTTAATC
TTCATCCTTGATTCTACAATCATGACAGTTGTCTTTAGTGACAAGGGAAAGAAGCCTTTTTATTAAGTTG
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CAATAGAAATTTAAACAGTGAGTGGAGACAACTTTTAAATGGAAGCTTCATATGAGAGAGGACGCCCACG
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GAGTTGAACCATTAACAGTTCCTCCAGCACCTAAAGACATATGTCCGACCTTGAAAAAAGGATTTTTGTG
TGACAGTAGTTTTTGCAAAAAAGATCACCAGTTGGAGAGTTTAACTGATAGGGAATTACTCCTACTAATC
GCCCGTAAGACTTGTGGATCAGTAGAACAACAATTAAATATAACTGCACCCAAGGACTCGCGCTTAGCAA
ATCCAACGGCTGATGATTTCCAGCAAGAGGAAGGTCCAAAAATTACCTTGTTGACACTGATCAAGACGGC
AGAACACTGGGCGAGACAAGACATCAGAACCATAGAGGATTCAAAATTAAGAGCATTGTTGACTCTATGT
GCTGTGATGACGAGGAAATTCTCAAAATCCCAGCTGAGTCTTTTATGTGAGACACACCTAAGGCGCGAGG
GGCTTGGGCAAGATCAGGCAGAACCCGTTCTCGAAGTATATCAACGATTACACAGTGATAAAGGAGGCAG
TTTTGAAGCTGCACTATGGCAACAATGGGACCGACAATCCCTAATTATGTTTATCACTGCATTCTTGAAT
ATTGCTCTCCAGTTACCGTGTGAAAGTTCTGCTGTCGTTGTTTCAGGGTTAAGAACATTGGTTCCTCAAT
CAGATAATGAGGAAGCTTCAACCAACCCGGGGACATGCTCATGGTCTGATGAGGGTACCCCTTAATAAGG
CTGACTAAAACACTATATAACCTTCTACTTGATCACAATACTCCGTATACCTATCATCATATATTTAATC
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TTGCCCTAATATATGAAGAGGTATGATACAACCCTAACAGTGATCAAAGAAAATCATAATCTCGTATCGC
TCGTAATATAACCTGCCAAGCATACCTCTTGCACAAAGTGATTCTTGTACACAAATAATGTTTTACTCTA
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TGTTATATTACAATCAATAACAAGCTTGTAAAAATATTGTTCTTGTTTCAAGAGGTAGATTGTGACCGGA
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CCAAGAGGCATTCTTCATCTCCTTTTAGCAAAGTACTATTTCAGGGTAGTCCAATTAGTGGCACGTCTTT
TAGCTGTATATCAGTCGCCCCTGAGATACGCCACAAAAGTGTCTCTAAGCTAAATTGGTCTGTACACATC
CCATACATTGTATTAGGGGCAATAATATCTAATTGAACTTAGCCGTTTAAAATTTAGTGCATAAATCTGG
GCTAACACCACCAGGTCAACTCCATTGGCTGAAAAGAAGCTTACCTACAACGAACATCACTTTGAGCGCC
CTCACAATTAAAAAATAGGAACGTCGTTCCAACAATCGAGCGCAAGGTTTCAAGGTTGAACTGAGAGTGT
CTAGACAACAAAATATTGATACTCCAGACACCAAGCAAGACCTGAGAAAAAACCATGGCTAAAGCTACGG
GACGATACAATCTAATATCGCCCAAAAAGGACCTGGAGAAAGGGGTTGTCTTAAGCGACCTCTGTAACTT
CTTAGTTAGCCAAACTATTCAGGGGTGGAAGGTTTATTGGGCTGGTATTGAGTTTGATGTGACTCACAAA
GGAATGGCCCTATTGCATAGACTGAAAACTAATGACTTTGCCCCTGCATGGTCAATGACAAGGAATCTCT
TTCCTCATTTATTTCAAAATCCGAATTCCACAATTGAATCACCGCTGTGGGCATTGAGAGTCATCCTTGC
AGCAGGGATACAGGACCAGCTGATTGACCAGTCTTTGATTGAACCCTTAGCAGGAGCCCTTGGTCTGATC
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TTATTATATGAATAAGCATTTTATCACCAGAAATCCTATATACTAAATGGTTAATTGTAACTGAACCCGC
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TAATCCGCAACTACGCAACTGTAAACTCCCGAAACATATCTACCGTTTGAAATACGATGTAACTGTTACC
AAGTTCTTGAGTGATGTACCAGTGGCGACATTGCCCATAGATTTCATAGTCCCAGTTCTTCTCAAGGCAC
TGTCAGGCAATGGATTCTGTCCTGTTGAGCCGCGGTGCCAACAGTTCTTAGATGAAATCATTAAGTACAC
AATGCAAGATGCTCTCTTCTTGAAATATTATCTCAAAAATGTGGGTGCTCAAGAAGACTGTGTTGATGAA
CACTTTCAAGAGAAAATCTTATCTTCAATTCAGGGCAATGAATTTTTACATCAAATGTTTTTCTGGTATG
ATCTGGCTATTTTAACTCGAAGGGGTAGATTAAATCGAGGAAACTCTAGATCAACATGGTTTGTTCATGA
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GGCATACACACATTGTTTCTGTTTCTACTGCCGACGTCTTGATAATGTGCAAAGATTTAATTACATGTCG
ATTCAACACAACTCTAATCTCAAAAATAGCAGAGATTGAGGATCCAGTTTGTTCTGATTATCCCAATTTT
AAGATTGTGTCTATGCTTTACCAGAGCGGAGATTACTTACTCTCCATATTAGGGTCTGATGGGTATAAAA
TTATTAAGTTCCTCGAACCATTGTGCTTGGCCAAAATTCAATTATGCTCAAAGTACACTGAGAGGAAGGG
CCGATTCTTAACACAAATGCATTTAGCTGTAAATCACACCCTAGAAGAAATTACAGAAATGCGTGCACTA
AAGCCTTCACAGGCTCAAAAGATCCGTGAATTCCATAGAACATTGATAAGGCTGGAGATGACGCCACAAC
AACTTTGTGAGCTATTTTCCATTCAAAAACACTGGGGGCATCCTGTGCTACATAGTGAAACAGCAATCCA
AAAAGTTAAAAAACATGCTACGGTGCTAAAAGCATTACGCCCTATAGTGATTTTCGAGACATACTGTGTT
TTTAAATATAGTATTGCCAAACATTATTTTGATAGTCAAGGATCTTGGTACAGTGTTACTTCAGATAGGA
ATCTAACACCGGGTCTTAATTCTTATATCAAAAGAAATCAATTCCCTCCGTTGCCAATGATTAAAGAACT
ACTATGGGAATTTTACCACCTTGACCACCCTCCACTTTTCTCAACCAAAATTATTAGTGACTTAAGTATT
TTTATAAAAGACAGAGCTACCGCAGTAGAAAGGACATGCTGGGATGCAGTATTCGAGCCTAATGTTCTAG
GATATAATCCACCTCACAAATTTAGTACTAAACGTGTACCGGAACAATTTTTAGAGCAAGAAAACTTTTC
TATTGAGAATGTTCTTTCCTACGCACAAAAACTCGAGTATCTACTACCACAATATCGGAACTTTTCTTTC
TCATTGAAAGAGAAAGAGTTGAATGTAGGTAGAACCTTCGGAAAATTGCCTTATCCGACTCGCAATGTTC
AAACACTTTGTGAAGCTCTGTTAGCTGATGGTCTTGCTAAAGCATTTCCTAGCAATATGATGGTAGTTAC
GGAACGTGAGCAAAAAGAAAGCTTATTGCATCAAGCATCATGGCACCACACAAGTGATGATTTTGGTGAA
CATGCCACAGTTAGAGGGAGTAGCTTTGTAACTGATTTAGAGAAATACAATCTTGCATTTAGATATGAGT
TTACAGCACCTTTTATAGAATATTGCAACCGTTGCTATGGTGTTAAGAATGTTTTTAATTGGATGCATTA
TACAATCCCACAGTGTTATATGCATGTCAGTGATTATTATAATCCACCACATAACCTCACACTGGAGAAT
CGAGACAACCCCCCCGAAGGGCCTAGTTCATACAGGGGTCATATGGGAGGGATTGAAGGACTGCAACAAA
AACTCTGGACAAGTATTTCATGTGCTCAAATTTCTTTAGTTGAAATTAAGACTGGTTTTAAGTTACGCTC
AGCTGTGATGGGTGACAATCAGTGCATTACTGTTTTATCAGTCTTCCCCTTAGAGACTGACGCAGACGAG
CAGGAACAGAGCGCCGAAGACAATGCAGCGAGGGTGGCCGCCAGCCTAGCAAAAGTTACAAGTGCCTGTG
GAATCTTTTTAAAACCTGATGAAACATTTGTACATTCAGGTTTTATCTATTTTGGAAAAAAACAATATTT
GAATGGGGTCCAATTGCCTCAGTCCCTTAAAACGGCTACAAGAATGGCACCATTGTCTGATGCAATTTTT
GATGATCTTCAAGGGACCCTGGCTAGTATAGGCACTGCTTTTGAGCGATCCATCTCTGAGACACGACATA
TCTTTCCTTGCAGGATAACCGCAGCTTTCCATACGTTTTTTTCGGTGAGAATCTTGCAATATCATCATCT
CGGGTTCAATAAAGGTTTTGACCTTGGACAGTTAACACTCGGCAAACCTCTGGATTTCGGAACAATATCA
TTGGCACTAGCGGTACCGCAGGTGCTTGGAGGGTTATCCTTCTTGAATCCTGAGAAATGTTTCTACCGGA
ATCTAGGAGATCCAGTTACCTCAGGCTTATTCCAGTTAAAAACTTATCTCCGAATGATTGAGATGGATGA
TTTATTCTTACCTTTAATTGCGAAGAACCCTGGGAACTGCACTGCCATTGACTTTGTGCTAAATCCTAGC
GGATTAAATGTCCCTGGGTCGCAAGACTTAACTTCATTTCTGCGCCAGATTGTACGCAGGACCATCACCC
TAAGTGCGAAAAACAAACTTATTAATACCTTATTTCATGCGTCAGCTGACTTCGAAGACGAAATGGTTTG
TAAATGGCTATTATCATCAACTCCTGTTATGAGTCGTTTTGCGGCCGATATCTTTTCACGCACGCCGAGC
GGGAAGCGATTGCAAATTCTAGGATACCTGGAAGGAACACGCACATTATTAGCCTCTAAGATCATCAACA
ATAATACAGAGACACCGGTTTTGGACAGACTGAGGAAAATAACATTGCAAAGGTGGAGCCTATGGTTTAG
TTATCTTGATCATTGTGATAATATCCTGGCGGAGGCTTTAACCCAAATAACTTGCACAGTTGATTTAGCA
CAGATTCTGAGGGAATATTCATGGGCTCATATTTTAGAGGGAAGACCTCTTATTGGAGCCACACTCCCAT
GTATGATTGAGCAATTCAAAGTGTTTTGGCTGAAACCCTACGAACAATGTCCGCAGTGTTCAAATGCAAA
GCAACCAGGTGGGAAACCATTCGTGTCAGTGGCAGTCAAGAAACATATTGTTAGTGCATGGCCGAACGCA
TCCCGAATAAGCTGGACTATCGGGGATGGAATCCCATACATTGGATCAAGGACAGAAGATAAGATAGGAC
AACCTGCTATTAAACCAAAATGTCCTTCCGCAGCCTTAAGAGAGGCCATTGAATTGGCGTCCCGTTTAAC
ATGGGTAACTCAAGGCAGTTCGAACAGTGACTTGCTAATAAAACCATTTTTGGAAGCACGAGTAAATTTA
AGTGTTCAAGAAATACTTCAAATGACCCCTTCACATTACTCAGGAAATATTGTTCACAGGTACAACGATC
AATACAGTCCTCATTCTTTCATGGCCAATCGTATGAGTAATTCAGCAACGCGATTGATTGTTTCTACAAA
CACTTTAGGTGAGTTTTCAGGAGGTGGCCAGTCTGCACGCGACAGCAATATTATTTTCCAGAATGTTATA
AATTATGCAGTTGCACTGTTCGATATTAAATTTAGAAACACTGAGGCTACAGATATCCAATATAATCGTG
CTCACCTTCATCTAACTAAGTGTTGCACCCGGGAAGTACCAGCTCAGTATTTAACATACACATCTACATT
GGATTTAGATTTAACAAGATACCGAGAAAACGAATTGATTTATGACAGTAATCCTCTAAAAGGAGGACTC
AATTGCAATATCTCATTCGATAATCCATTTTTCCAAGGTAAACGGCTGAACATTATAGAAGATGATCTTA
TTCGACTGCCTCACTTATCTGGATGGGAGCTAGCCAAGACCATCATGCAATCAATTATTTCAGATAGCAA
CAATTCATCTACAGACCCAATTAGCAGTGGAGAAACAAGATCATTCACTACCCATTTCTTAACTTATCCC
AAGATAGGACTTCTGTACAGTTTTGGGGCCTTTGTAAGTTATTATCTTGGCAATACAATTCTTCGGACTA
AGAAATTAACACTTGACAATTTTTTATATTACTTAACTACTCAAATTCATAATCTACCACATCGCTCATT
GCGAATACTTAAGCCAACATTCAAACATGCAAGCGTTATGTCACGGTTAATGAGTATTGATCCTCATTTT
TCTATTTACATAGGCGGTGCTGCAGGTGACAGAGGACTCTCAGATGCGGCCAGGTTATTTTTGAGAACGT
CCATTTCATCTTTTCTTACATTTGTAAAAGAATGGATAATTAATCGCGGAACAATTGTCCCTTTATGGAT
AGTATATCCGCTAGAGGGTCAAAACCCAACACCTGTGAATAATTTTCTCTATCAGATCGTAGAACTGCTG
GTGCATGATTCATCAAGACAACAGGCTTTTAAAACTACCATAAGTGATCATGTACATCCTCACGACAATC
TTGTTTACACATGTAAGAGTACAGCCAGCAATTTCTTCCATGCATCATTGGCGTACTGGAGGAGCAGACA
CAGAAACAGCAACCGAAAATACTTGGCAAGAGACTCTTCAACTGGATCAAGCACAAACAACAGTGATGGT
CATATTGAGAGAAGTCAAGAACAAACCACCAGAGATCCACATGATGGCACTGAACGGAATCTAGTCCTAC
AAATGAGCCATGAAATAAAAAGAACGACAATTCCACAAGAAAACACGCACCAGGGTCCGTCGTTCCAGTC
CTTTCTAAGTGACTCTGCTTGTGGTACAGCAAATCCAAAACTAAATTTCGATCGATCGAGACACAATGTG
AAATTTCAGGATCATAACTCGGCATCCAAGAGGGAAGGTCATCAAATAATCTCACACCGTCTAGTCCTAC
CTTTCTTTACATTATCTCAAGGGACACGCCAATTAACGTCATCCAATGAGTCACAAACCCAAGACGAGAT
ATCAAAGTACTTACGGCAATTGAGATCCGTCATTGATACCACAGTTTATTGTAGATTTACCGGTATAGTC
TCGTCCATGCATTACAAACTTGATGAGGTCCTTTGGGAAATAGAGAGTTTCAAGTCGGCTGTGACGCTAG
CAGAGGGAGAAGGTGCTGGTGCCTTACTATTGATTCAGAAATACCAAGTTAAGACCTTATTTTTCAACAC
GCTAGCTACTGAGTCCAGTATAGAGTCAGAAATAGTATCAGGAATGACTACTCCTAGGATGCTTCTACCT
GTTATGTCAAAATTCCATAATGACCAAATTGAGATTATTCTTAACAACTCAGCAAGCCAAATAACAGACA
TAACAAATCCTACTTGGTTTAAAGACCAAAGAGCAAGGCTACCTAAGCAAGTCGAGGTTATAACCATGGA
TGCAGAGACAACAGAGAATATAAACAGATCGAAATTGTACGAAGCTGTATATAAATTGATCTTACACCAT
ATTGATCCTAGCGTATTGAAAGCAGTGGTCCTTAAAGTCTTTCTAAGTGATACTGAGGGTATGTTATGGC
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