Virus Name
Human foamy virus (HFV)
  Lineage
Viruses; Riboviria; Pararnavirae; Artverviricota; Revtraviricetes; Ortervirales; Retroviridae; Spumaretrovirinae; Spumavirus; Simian foamy virus
  Virus Molecule Type
ssRNA-RT
  Sequence ID
Y07725.1
  Genome Type
Non-segmented
  Related Host Pan troglodytes Homo sapiens Mesocricetus auratus
  External Link
 Taxon ID 11641
 Virus-Host DB https://www.genome.jp/virushostdb/11641

    Virion Information
Enveloped, spherical to pleomorphic in shape, 80-100 nm in diameter.
    GENOME Information
Monopartite, linear, dimeric, ssRNA(+) genome of about 7-11 kb,, with a 5'-cap and a 3'poly-A tail. There are two long terminal repeats (LTRs) at the 5' and 3' ends. The LTRs contain the U3, R, and U5 regions. There are also a primer binding site (PBS) at the 5'end and a polypurine tract (PPT) at the 3'end.
RNA Binding Site RNA Detail Protein Name Host Species Uniprot ID Protein Detail
5'UTR - 3'UTR RNA Info Acidic protein rich in leucines Homo sapiens Q92688 Pro Info
5'UTR - stem lops RNA Info ELAV-like protein 1 Homo sapiens Q15717 Pro Info
5'UTR - 3'UTR RNA Info Mapmodulin Homo sapiens P39687 Pro Info
5'UTR - 3'UTR RNA Info Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 Homo sapiens P26196 Pro Info

RNA Binding Site RNA Detail HncRNA Name Host Species External Link HncRNA Detail
5'UTR - 3'UTR RNA Info hsa-miR-32-5p Homo sapiens miRBase HncRNA Info

>Y07725.1 Human foamy virus proviral DNA, complete genome HFV TGTGGTGGAATGCCACTAGAAACTAGGGAAAACTAGGAGGAGAGTATTACAGGGAAGGAAGTGAAGAACC TCGTGACCCAAATACTCCTGCTCCTCATAGACGTACCTGGGATGAGAGACACAAGGTTCTTAAATTGTCC TCATTCGCTACTCCCTCTGACATCCAACGCTGGGCTACTAAAGCATTGCCTTATGGCTGGAAAGTGGTCA CCGAAAGCGGAAATGATTATACTAGCCGCAGAAAGATCAGAACATTGACAGAGATGACTCAGGATGAAAT TAGAAAAAGGTGGGAAAGTGGATATTGTGACCCCTTCATTGACTCAGGAAGTGACTCAGATGGACCCTTC TAAAAGCCACAGACAGTAAAAATGTGTTAGCACTTTATACAATATTATATCTGCTTAAGCTATAGAAGCT TTCACATACTCAGTAGCTGTTTCACAATCAACAAAACAATGATGATGTAATCATAAGGAAGTAGTTTAAA ATAGGTTAAGTAAGTTTACTGCAGTAGATAATCCCTGGGGAGGATCTGGCTCTGTAAGCTGGAACAGCAA TGTTTTCAGTTCCAATCCTCTCAAAGGAGAACCAGAGGGATGATGTGTTAGTTCAAATCCCATTATCCTC ATGGTTCCCTTTTCCATAGTTTACTATATTAATTTAAGGATAAGGTTATATATGCTTTGCTATCCCTGAA GGAAGCATAGCTCTTCAGGTAAAGAGGCCAGTATTAAAAGAGCTACCCTTCCTTTTCATATAAGGATCGA AACCTGCTTACGTTTTACTTTAATAAAGTTAAGTTTTAAGTTTTAACAGGAAATGCTCTTAGGCAGAAGG TAGCTCCCTCGACTGGGTGACAAGGAAGAAACCATTCAGGAAGTGCTTCCTTCTGCTCGGGGAGATACAT 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