Details of Virus RNA

  Strain Information Strain Name
Human rhinovirus (strain 16)
Strain Family
Enterovirus
RNA Binding Site
5'UTR - 3'UTR
  Virus Information Virus Name
Human rhinovirus (HRV)
Taxonomy ID 31708
GeneBank ID L24917

Full list of proteins interacting with the 5'UTR - 3'UTR of this Strain

Protein Name Uniprot ID Host Species Pro Info Detection Method Infection Cell Cell ID Cell Originated Tissue Infection Time Interaction Score Fold Change
Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 Q14103 Homo sapiens Pro Info Nano-liquid chromatographytandem mass spectrometry (nanoLC-MS/MS) HeLa Cells (Human cervical carcinoma cell) . Cervix 16 h . .

Virus RNA Sequence Information

>LC699418.1 Rhinovirus A16 HRV_A16_Fukushima_H561_2019 genomic RNA, complete genome TAAAACTGGATCTGGGTTGTTCCCACCCAGATCACCTACATGGTGTTGTACACTATTATTACGGTAATTT TGTACGCCAGTTTTATATCCCCTTCCCTTAATGTAACTTAGAAGCAAAGCAAACCGATCAATAGGGGACA ATCATCCAGATTGTCAAAGATCAAGCACTTCTGTTTCCCCGGTCAAAGTTGATATGCTCCACAAGGGCAA AAACAACTGAGATCGTTATCCGCAAGATGCCTACGCAAAGCCTAGTAACATATTGAAAGATACTTGGTTG GTCGCTCAGCTGTTAACCCAACAGTAGACCTGGCAGATGAGGCTAGAGATTCCCCTCCGGCGACGGAGTT CTAGCCTGCGTGGCTGCCTGCACACCCTTTGGGTGTGAAGCCAAATATTGGACAAGGTGTGAAGAGCCAC GTGTGCTCATCTTGAGTCCTCCGGCCCCTGAATGTGGCTAACCTTAAACCTGCAGCCAGTGCACACAATC CAGTGTGTAGCTGGTCGTAATGAGCAATTGCGGGATGGGACCAACTACTTTGGGTGTCCGTGTTTCACTT TTTCCTTTTATTATTGCTTATGGTGACAATATATATAGCATATATATATTGTTATCATGGGCGCCCAAGT ATCCAGACAGAACGTTGGTACGCACTCAACACAAAATATGGTGTCAAATGGATCCAGTCTCAATTATTTT AACATCAATTATTTTAAAGATGCAGCCTCCAGTGGTGCTTCTCGATTGGACTTTTCTCAAGATCCTAGTA AGTTCACAGACCCAGTTAAGGATGTATTGGAGAAAGGCATACCCACGTTGCAATCTCCAAGTGTAGAGGC 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